La actividad de Investigación se promueve en la Facultad de Ciencias Médicas como una función sustantiva institucional, a través de subsidios y becas, el desarrollo de Proyectos y Programas, con el objetivo de obtener nuevos conocimientos para la creación, actualización y desarrollo de la ciencia.

En general, estas actividades se desarrollan en base a distintas fuentes de financiamiento: esta Unidad Académica recibe fondos a través de la Secretaría de Ciencia, Técnica y Posgrado, del Presupuesto general de la Universidad, para sustentar proyectos institucionales, becas y ayuda para mantenimiento de equipos de uso común, y por otra parte, financiamiento para proyectos de investigación en el área biomédica.
Estos Proyectos de Investigación son acreditados (con evaluación externa), financiados por la Universidad Nacional de Cuyo, y se han incrementado paulatinamente en los últimos períodos: de 37 proyectos del período 1999-2001, se pasó a 40 durante 2002-2004, 46 en 2005-2007 y 52 en 2007-2009. En la convocatoria actual (2009-2011) esta Unidad Académica cuenta con 60 proyectos acreditados. Éstos permiten que sus integrantes puedan participar en el Programa de Incentivos a los Docentes Investigadores, dependiente del Ministerio de Educación de la Nación.

Se ha considerado desde hace varios años, la importancia y la necesidad de que en esta Unidad Académica se desarrollen proyectos de investigación, armonizando la inversión en proyectos de investigación biomédica básica con la investigación clínica. Con esta finalidad, la Secretaría de Ciencia y Técnica de la Facultad propuso en el año 2003 la realización de proyectos de integración clínico-básicos, experiencia que ha sido calificada como exitosa, a la vista de los resultados obtenidos, la integración de docentes-investigadores pertenecientes a los dos ciclos de la carrera y la potenciación de experiencias a partir de esta integración.
Las actuales autoridades destacan como parte de su política de gestión, el fortalecimiento de la Investigación clínica, por esta razón está en vigencia actualmente una línea de Proyectos para el Desarrollo de la Investigación clínica integrada con la Investigación Básica – versión 2009, aprobada por Res. 16/2009 CD, que permite el financiamiento con fondos propios de cinco proyectos con estas características.

Las actividades de Investigación en la Carrera de Medicina son llevadas a cabo por:

• Docentes-investigadores que pertenecen actualmente a la planta docente: Investigadores, becarios y técnicos de Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICET) y de la Agencia nacional de Promoción de la Científica y Tecnológica (ANPCyT).

• Becarios de la Universidad: estudiantes, graduados, maestrandos y doctorandos.

• Graduados de la carrera de Medicina o de otras carreras que realizan su maestría o doctorado en Posgrados de la FCM.

• Adscriptos “ad honorem”, como integrantes de Proyectos.

El impacto de estas actividades es amplio, y deben destacarse la importante transferencia en publicaciones y presentaciones en reuniones científicas, los premios obtenidos y la obtención de subsidios a través de fuentes nacionales e internacionales. Es preciso destacar las numerosas distinciones obtenidas por los miembros de esta comunidad universitaria en los últimos años. Han sido otorgados por Instituciones nacionales e internacionales. Abarcan diferentes disciplinas o méritos vinculados a las Ciencias Biomédicas, incluyendo trabajos de investigación básica y aplicada, educación médica y distinciones personales o grupales por producciones de relevancia.